A heparin glükózamin és hexuronsav (d-glükuronsav és 1-iduronsav) egységekből felépülő polianionos, lineáris poliszacharid, mely a sejtek felületén és az extracelluláris mátrixban fordul elő proteoglikánok formájában. Antikoaguláns hatását az antitrombin (szerin-proteáz inhibitor) allosztérikus aktiválásával fejti ki. A hatás kiváltásához elengedhetetlen a molekulán belül előforduló egyedi pentaszacharid szekvencia (1, DEFGH) jelenléte, melynek anionos jellegű csoportjai (szulfátészter/karboxil) erős ionos kölcsönhatásokat alakítanak ki az antitrombin bázikus csoportjaival. A pentaszacharid egy szintetikusan előállított változatát 2001 óta alkalmazzák a gyógyászatban Arixtra néven. Az elmúlt másfél évtizedben a vegyület számos mimetikumát állították elő, melyek elődjüknél egyszerübben és könnyebben szintetizálhatóak voltak. A vezérmolekula teljesen O-metilezett és O-szulfatált változata az idraparinux, mely kiemelkedő antikoaguláns aktivitással rendelkezik.